微生物作为地球环境中的一大类生物群体,每种微生物都有其独特的功能。微生物学作为生物学的分支学科之一,在许多学科领域都发挥着举足轻重的作用。近年来,微生物学作为新兴学科迅速蓬勃发展,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口,为推动我国微生物学的发展,提高从业人员的技术水平,更好地与微生物研究领域的专家学者们分享、交流在微生物研究领域中的心得、经验。应广大技术工作者的要求,北京软研国际信息技术研究院特举办“微生物组学研究及数据分析”培训班,本次培训由互动派(北京)教育科技有限公司具体承办,具体相关事宜通知如下:
【时间地点】
“微生物组学研究及后期数据分析处理”专题培训班
2019年07月12日—07月15日 北京(时间安排:第1天报到,授课3天)
“循证医学Meta分析核心技术与应用”专题培训班
2019年07月18日—07月21日 北京(时间安排:第1天报到,授课3天)
培训专题:“微生物组学研究及后期数据分析处理”专题培训班
主办单位:北京软研国际信息技术研究院
承办单位:互动派(北京)教育科技有限公司
培训地点:北京
培训时间:
2019年7月12日——7月15日;
报到时间:2019年7月12日 上午10点开始
报名截止:名额有限,报满为止
“微生物组学研究及后期数据分析处理”专题培训班大纲
课程 |
授课内容 |
一、微生物学研究方法进展及新方法发展趋势 |
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1 微生物学研究方法进展及新方法发展趋势
- 1.1 PCR 扩增技术; DGGE 技术; 末端限制性片段多态性分析技术(T-RFLP)
- 1.2 荧光原位杂交技术(FISH); 基因芯片技术; 克隆文库技术
- 1.3 高通量测序技术;
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二、微生物基因组学数据分析流程和结果展示 |
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2 微生物基因组学数据分析流程
- 2.1 原始数据评估(fastq格式、fastqc质控:低质量;PCR重复;接头序列解读)
- 2.2 基因组拼接、画图(拼接原理、主要输出结果:contigs; scaffolds、图形展示:CGview,OGDRAW等)
- 2.3 功能注释 (KEGG代谢富集分析、COG功能分析、islandviewer基因组岛预测、CARD/resfinder耐药基因预测等)
- 2.4 进化树分析 (blast配对比对、clustalw多序列比对、MEGA进化树构建、evolview进化树注释)
- 2.5 多菌株泛基因组分析 (PanGP泛基因组绘图)
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三、微生物转录组学数据分析流程和结果展示 |
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3 微生物转录组学数据分析流程
- 3.1 转录组学实验设计、研究思路及 SCI 论文撰写思路
mRNA 提取,cDNA 合成,测序文库构建,文库质量检测,上机测序
- 3.2 转录组数据分析流程
原始数处理、过滤及质量评估,高质量序列获取,参考基因组比对分析、基因表达量分析,基因表达量标准化
- 3.3 转录组基因功能注释
DESeq2基因表达差异分析、Pheatmap 差异表达基因双向聚类分析,差异表达基因GO、KEGG 富集分析
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四、微生物宏基因组研究技术 |
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4 微生物多样性与宏基因组研究技术
- 4.1 微生物多样性和宏基因组学样本要求,概念、原理及实验设计、研究思路及 SCI 论文撰写思路
- 4.2 实验流程 总 DNA 提取、目标片段 PCR 扩增、产物回收、产物质量 评估、测序文库制备
- 4.3 微生物多样性和宏基因组学案例
肠道微生物、土壤微生物、水环境微生物、人体皮肤微生物等案例
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5 微生物多样性和宏基因组学数据分析
- 5.1 微生物多样性的数据分析流程
(细菌16S、真菌ITS、功能基因nifH、nirK、nirS、 nosZ、mcrA等)
- 5.2 原始数据整理、过滤及质量评估、OTU划分和分类地位鉴定、Alpha多样性分析
(Rarefaction稀疏曲线、Specaccum物种累积曲线、丰度等级曲线)
- 5.3 Alpha多样性指数计算
(Chao1丰富度估计指数、ACE 丰富度估计指数、Simpson 多样性指数)分类学组成分析,样本(组)间分类学组成的差异分析)
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五、辅助课程 |
- 经典文献及最新文献解读,案例分析;
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Meta分析是循证医学中得到高质量研究证据的重要方法之一。熟练掌握和使用系统评价/Meta分析方法,将有助于正确解读医学期刊发表的有关论文结果,有利于提高临床研究设计的质量及发表高水平科研论文的能力,而对于临床医务工作者而言,更是提高自身临床能力的必备技能。为推动我国临床学的发展,提高从业人员的技术水平,更好地与循证医学研究领域的专家学者们分享、交流在微生物研究领域中的心得、经验。应广大技术工作者的要求,北京软研国际信息技术研究院特举办“循证医学Meta分析核心技术与应用”培训班,本次培训由互动派(北京)教育科技有限公司具体承办,具体相关事宜通知如下:
【时间地点】
“循证医学Meta分析核心技术与应用”专题培训班
2019年07月18日—07月21日 北京(时间安排:第1天报到,授课3天)
“微生物组学研究及后期数据分析”专题培训班
2019年07月12日—07月15日 北京(时间安排:第1天报到,授课3天)
培训专题:
“循证医学Meta分析核心技术与应用”专题培训班
主办单位:北京软研国际信息技术研究院
承办单位:互动派(北京)教育科技有限公司
培训地点:北京
培训时间:2019年7月18日——7月21日;
报到时间:2019年7月18日 上午10点开始
报名截止:名额有限,报满为止
循证医学Meta分析核心技术与应用课程大纲
授课题目 |
授课内容 |
一、循证医学与系统综述/Meta分析
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- 1. 循证医学简介
- 2. 循证医学实践
- 3. 系统综述
- 4. Meta分析
- 5.Cochrane协作网及Cochrane系统综述
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二、研究问题设定及系统综述研究方案撰写
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- 1. PICOS
- 2. 研究方案框架
- 3. 研究方法注册
- 4. Cochranme研究方案撰写及实例演示
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三、文献检索
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- 1. 中文数据库文献检索:CBN,CNKI,VIP,万方
- 2. 英文文献检索:Pubmed
- 3. Cochrane图书馆文件检索
- 4. 文献检索的方法与流程
- 5. 文献管理软件Endnote、Revman软件安装及简介
- 6. 参考文献添加、分类、删除与引用
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四、偏倚风险评价
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- 1. 偏倚评价的重要性
- 2. Cochrane偏倚风险评价工具
- 3. 偏倚评估结果展示
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五、资料提取设计
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- 1.资料提取表设计(一般资料,PICO,其他信息)
- 2.Revman资料提取、录入、结果报告与解读
添加比较、结局、亚组、研究;二分类资料的录入与分析;定量资料的录入与分析
实例操作:资料提取设计和提取练习
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六、统计方法分析
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- 1. Meta分析的原理
- 2. Meta分析的步骤
- 3. 分类资料的Meta分析
- 4. 数值资料的Meta分析
- 5. Revman软件meta演示
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七、异质性处理
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- 1. 异质性的来源及定义
- 2. 异质性的检验
- 3. 异质性的分析
- 4. 异质性的处理
- 5. 异质性处理的Revman演示
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八、Grade证据评级及SOF表制作
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- 1. GRADE简介
- 2. 证据质量相关因素
- 3. GRADE等级评价方法
- 4. SoF表的制作步骤
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九、Meta分析结果解读和论文撰写
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- 1. Meta分析结果解读
实例:《Cochrane database of systematic reviews》IF:6.8
- 2. 系统综述结论撰写
- 3. 系统综述类SCI论文撰写要点
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【联系方式】
【培训特色】
1、培训教室配备有电脑(每人一台)、服务器、投影;
课程讲解由浅入深、理论+实践、边讲边练;
帮助所有学员快速上手,逐步进阶提高,力求在短时间内掌握程序的运用,
并顺利迁移至目标研究体系,解决实际模拟计算难题。
2、课堂上邀请学员进入 专属班级交流群,分享内部资料,
学员学完后可以继续在班级群与老师同学交流问题。
另外随着课程的不断优化,我们为老学员提供了专属增值服务,
参加一次培训,后期本人可以免费再参加一次。
3、 此通知长期有效,最新培训会议信息可关注官方网站
srit.ac.cn或者
www.hdpaii.com
4、 也可加入全国大学生学术交流平台
极客学术
与全国同行业者互动交流。
【报名费用】
1、微生物组学专题班每人¥3900元;
06月25日之前报名汇款每人优惠300元(优惠名额有限);
2、循证医学meta分析专题班每人¥3300元;
06月25日之前报名汇款每人优惠300元(优惠名额有限);
3、如需开具会议费的单位请联系招生老师索要会议邀请函
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课程详细安排请按照文件中的联系方式联系招生老师
【付款方式】
【注意事项】
1、教室机位按报名先后顺序安排;预报名学员请及时联系招生部老师进行报名并确认是否报名成功
2、培训报道时统一开具增值税普通发票和盖章邀请函,如需开具增值税专用发票请提前告知招生部老师;
汇款后如需提前开票也请及时告知招生部老师;
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